Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB6CQ53S08 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB6CQ53S08 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms