Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZC2HC1CQ53FD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZC2HC1CQ53FD0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms