Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKN1Q16512 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKN1Q16512 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
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