Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ZNHIT3Q15649 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNHIT3Q15649 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ZNHIT3Q15649 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ZNHIT3Q15649 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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ZNHIT3Q15649 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ZNHIT3Q15649 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ZNHIT3Q15649 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ZNHIT3Q15649 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNHIT3Q15649 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms