Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RYR3Q15413 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RYR3Q15413 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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