Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NCF4Q15080 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NCF4Q15080 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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