Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CBFBQ13951 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms