Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP1A4Q13733 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP1A4Q13733 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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