Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR5A1Q13285 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR5A1Q13285 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR5A1Q13285 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR5A1Q13285 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR5A1Q13285 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR5A1Q13285 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR5A1Q13285 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms