Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME3Q13232 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME3Q13232 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME3Q13232 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME3Q13232 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NME3Q13232 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NME3Q13232 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NME3Q13232 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NME3Q13232 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NME3Q13232 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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