Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MRPL28Q13084 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRPL28Q13084 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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