Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FOXD4Q12950 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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FOXD4Q12950 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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