Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAF2Q12933 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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TRAF2Q12933 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAF2Q12933 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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