Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BPTFQ12830 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BPTFQ12830 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms