Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNH2Q12809 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
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