Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 REE1YJL217W 597 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 EMC2YJR088C 879 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YLL044WYLL044W 447 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 COX5AYNL052W 462 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YNL092WYNL092W 1203 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RPL1AYPL220W 654 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 snR36snR36 182 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YBR232CYBR232C 360 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 BRN1YBL097W 2265 nt5.87□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 STB5YHR178W 2232 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 HSP82YPL240C 2130 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 SWC4YGR002C 1431 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 DPB4YDR121W 591 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 GLO2YDR272W 825 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 BSC2YDR275W 708 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 CYC7YEL039C 342 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 VMA10YHR039C-A 345 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 CDC42YLR229C 576 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ICY1YMR195W 384 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RMI1YPL024W 726 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ESC8YOL017W 2145 nt5.86□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 TPO3YPR156C 1869 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 VAN1YML115C 1608 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YBR139WYBR139W 1527 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 TRE1YPL176C 2352 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 MPC3YGR243W 441 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ATG36YJL185C 882 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RUF23RUF23 254 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 TOS6YNL300W 309 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 DGK1YOR311C 873 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RPS6AYPL090C 711 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YPR098CYPR098C 486 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 RPS6BYBR181C 711 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 DAL4YIR028W 1908 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 VHT1YGR065C 1782 nt5.85□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ASF2YDL197C 1578 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 MSS1YMR023C 1581 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ATP2YJR121W 1536 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ZPR1YGR211W 1461 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 CUE3YGL110C 1875 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 SIA1YOR137C 1869 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 AIM3YBR108W 2844 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 API2YDR525W 330 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 ECO1YFR027W 846 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 NBL1YHR199C-A 222 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 COA1YIL157C 594 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YJR012CYJR012C 624 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 YOR331CYOR331C 558 nt5.84□□□□□ -1.47
TY1A-NL2Q12470 GIP1YBR045C 1920 nt5.84□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 SIS2YKR072C 1689 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YCR007CYCR007C 720 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YDR102CYDR102C 333 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YJL144WYJL144W 315 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 MRPL38YKL170W 417 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 ERG3YLR056W 1098 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YPL108WYPL108W 507 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 PFK2YMR205C 2880 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YNR063WYNR063W 1824 nt5.83□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 TOG1YER184C 2385 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 CDC36YDL165W 576 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 TGA1tA(UGC)A 73 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 CBR1YIL043C 855 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 SUE1YPR151C 621 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 ECM3YOR092W 1842 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 AFG1YEL052W 1530 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 HPR1YDR138W 2259 nt5.82□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 GEX2YKR106W 1848 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 TUB3YML124C 1338 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 ARP5YNL059C 2268 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 PEP7YDR323C 1548 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YDR431WYDR431W 312 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 PPM1YDR435C 987 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 SDH7YDR511W 402 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 PMI40YER003C 1290 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YJL213WYJL213W 996 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YNL338WYNL338W 159 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 FRM2YCL026C-A 582 nt5.81□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 ZUO1YGR285C 1302 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 HRD1YOL013C 1656 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 JAC1YGL018C 555 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 THI4YGR144W 981 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 TDH3YGR192C 999 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 LSO1YJR005C-A 282 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 TDH2YJR009C 999 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 LCL2YLR104W 396 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 MRPL19YNL185C 477 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 MET31YPL038W 534 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 FCY1YPR062W 477 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YCL023CYCL023C 348 nt5.8□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 ALE1YOR175C 1860 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-NL2Q12470 YDR115WYDR115W 318 nt5.79□□□□□ -1.48
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