Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SPO73YER046W 432 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 TDA2YER071C 381 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 VTC2YFL004W 2487 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SEC53YFL045C 765 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YFL068WYFL068W 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 Q0143Q0143 153 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 LAG1YHL003C 1236 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YKL044WYKL044W 321 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 CSE4YKL049C 690 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 BLI1YKL061W 342 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 COX8YLR395C 237 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YOL131WYOL131W 327 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 PUF2YPR042C 3228 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 PKC1YBL105C 3456 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ARG4YHR018C 1392 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 CDC48YDL126C 2508 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RGT1YKL038W 3513 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ATP1YBL099W 1638 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 PKP2YGL059W 1476 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ASI3YNL008C 2031 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SUB2YDL084W 1341 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 TRE1YPL176C 2352 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ATP8Q0080 147 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 DPH1YIL103W 1278 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RPL17BYJL177W 555 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 MED11YMR112C 396 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 PAU19YMR325W 375 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YOR268CYOR268C 399 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 VPS69YPR087W 321 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 MSE1YOL033W 1611 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SNZ3YFL059W 897 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 MRM2YGL136C 963 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YGR069WYGR069W 336 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YKR041WYKR041W 753 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 CDC42YLR229C 576 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ERG2YMR202W 669 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YPT53YNL093W 663 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RUF23RUF23 254 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RPS3YNL178W 723 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YNL198CYNL198C 303 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SNZ2YNL333W 897 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RCR1YBR005W 642 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ROG3YFR022W 2202 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YJR098CYJR098C 1971 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 STE24YJR117W 1362 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 CAB3YKL088W 1716 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 PHO90YJL198W 2646 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 GPT2YKR067W 2232 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RFA1YAR007C 1866 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 GLO2YDR272W 825 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YML018CYML018C 1182 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YOL160WYOL160W 342 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YPR098CYPR098C 486 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 MRPL51YPR100W 423 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 HXT5YHR096C 1779 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 OXP1YKL215C 3861 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SER33YIL074C 1410 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 MRPL11YDL202W 750 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RPS11AYDR025W 471 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 EGD2YHR193C 525 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YIR020CYIR020C 303 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YJR012CYJR012C 624 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YKL070WYKL070W 510 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 MEH1YKR007W 555 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YLL044WYLL044W 447 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 UNG1YML021C 1080 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 PAI3YMR174C 207 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 POF1YCL047C 777 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YOR365CYOR365C 2112 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 RBA50YDR527W 1320 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 KIN3YAR018C 1308 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 AGA1YNR044W 2178 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 GUD1YDL238C 1470 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 LAP3YNL239W 1365 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 ADY2YCR010C 852 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SAE2YGL175C 1038 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 YLL056CYLL056C 897 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SSK1YLR006C 2139 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SCS7YMR272C 1155 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 VHR1YIL056W 1923 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-DR3Q12441 SSA2YLL024C 1920 nt5.22□□□□□ -1.57
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