Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 STT4YLR305C 5703 nt3.17□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 SPO71YDR104C 3738 nt3.17□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 YPR148CYPR148C 1308 nt3.17□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 DOA4YDR069C 2781 nt3.17□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 ASI1YMR119W 1875 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 RCY1YJL204C 2523 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 PIB1YDR313C 861 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 FOL2YGR267C 732 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 AIM23YJL131C 1071 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 YNL035CYNL035C 1170 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 YBR013CYBR013C 390 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 YPR078CYPR078C 1119 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 MON1YGL124C 1935 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 GIS4YML006C 2325 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 GSC2YGR032W 5688 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 NEM1YHR004C 1341 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 RTT109YLL002W 1311 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 ULP1YPL020C 1866 nt3.16□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 URC2YDR520C 2319 nt3.15□□□□□ -1.9
HMS1Q12398 TAF1YGR274C 3201 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SPT15YER148W 723 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RPN1YHR027C 2982 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YKE4YIL023C 1041 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YBL065WYBL065W 345 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RIB4YOL143C 510 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SUR1YPL057C 1149 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RRP5YMR229C 5190 nt3.15□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 TRM12YML005W 1389 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SDS23YGL056C 1584 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 LST7YGR057C 729 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 FIP1YJR093C 984 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 TMA19YKL056C 504 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 AHP1YLR109W 531 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RIM11YMR139W 1113 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YBR137WYBR137W 540 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SET1YHR119W 3243 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SMI1YGR229C 1518 nt3.14□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 JEN1YKL217W 1851 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SEC59YMR013C 1560 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 GEP7YGL057C 864 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 CUP1-1YHR053C 186 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 CUP1-2YHR055C 186 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 DUG3YNL191W 1074 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 UFE1YOR075W 1041 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RPS10AYOR293W 318 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 DAN4YJR151C 3486 nt3.13□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 NHP10YDL002C 612 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 TSC13YDL015C 933 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 MRPL11YDL202W 750 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RAD55YDR076W 1221 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RSM26YJR101W 801 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 VPS25YJR102C 609 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 BOS1YLR078C 735 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YBL062WYBL062W 381 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 ATG34YOL083W 1239 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 PHO88YBR106W 567 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 APA1YCL050C 966 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 FAR1YJL157C 2493 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 ART10YLR392C 1557 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 ALG1YBR110W 1350 nt3.12□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 MIC60YKR016W 1623 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 MRH4YGL064C 1686 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 COP1YDL145C 3606 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 MDM10YAL010C 1482 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YPL109CYPL109C 1974 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RPS29BYDL061C 171 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 TAN1YGL232W 870 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 GTT1YIR038C 705 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 IRC18YJL037W 675 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 CMC1YKL137W 336 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 UNG1YML021C 1080 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SLA1YBL007C 3735 nt3.11□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 SLI1YGR212W 1407 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 TLG1YDR468C 675 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 PFS1YHR185C 714 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 POG1YIL122W 1056 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YJR111CYJR111C 852 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YMR099CYMR099C 894 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 FYV6YNL133C 522 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 DDP1YOR163W 567 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 DSL1YNL258C 2265 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 RRM3YHR031C 2172 nt3.1□□□□□ -1.91
HMS1Q12398 YBR238CYBR238C 2196 nt3.1□□□□□ -1.91
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