Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 ARO1YDR127W 4767 nt3.34□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 CHA4YLR098C 1947 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YPL109CYPL109C 1974 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RPS29BYDL061C 171 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 snR78snR78 87 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 CLB3YDL155W 1284 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RRP8YDR083W 1179 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RNH202YDR279W 1053 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 IRC18YJL037W 675 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 HOT13YKL084W 351 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RPS21AYKR057W 264 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 PCD1YLR151C 1023 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RLP7YNL002C 969 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 AAH1YNL141W 1044 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 VAM3YOR106W 852 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YPR142CYPR142C 564 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 ACK1YDL203C 1872 nt3.33□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YHR080CYHR080C 4038 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 ARG5,6YER069W 2592 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 DSS1YMR287C 2910 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 CTH1YDR151C 978 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 MRPS35YGR165W 1038 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 LAC1YKL008C 1257 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 GMH1YKR030W 822 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YLR444CYLR444C 303 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RPL13BYMR142C 600 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 HUT1YPL244C 1020 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 SEC59YMR013C 1560 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 VTC4YJL012C 2166 nt3.32□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 TRM1YDR120C 1713 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 APN2YBL019W 1563 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 MEK1YOR351C 1494 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YCR016WYCR016W 873 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 OPI6YDL096C 327 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 QRI7YDL104C 1224 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YOS1YER074W-A 258 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 KEG1YFR042W 603 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 KXD1YGL079W 657 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 IMP3YHR148W 552 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YOR082CYOR082C 342 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RFM1YOR279C 933 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 TFB6YOR352W 1032 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 CIN8YEL061C 3003 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 STE6YKL209C 3873 nt3.31□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 SNT1YCR033W 3681 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RIT1YMR283C 1542 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 PST1YDR055W 1335 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 FRE4YNR060W 2160 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YDL242WYDL242W 354 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RRG1YDR065W 1098 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YDR290WYDR290W 330 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 TLG1YDR468C 675 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YER138W-AYER138W-A 105 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 ECO1YFR027W 846 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 AML1YGR001C 747 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 TAM41YGR046W 1158 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 USB1YLR132C 873 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 PBA1YLR199C 831 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 SEC65YML105C 822 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 ATG16YMR159C 453 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 OXR1YPL196W 822 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 SPP381YBR152W 876 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YGR237CYGR237C 2358 nt3.3□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 SIN4YNL236W 2925 nt3.29□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 KTR6YPL053C 1341 nt3.29□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RUF20RUF20 443 nt3.29□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 GRX1YCL035C 333 nt3.29□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 CTM1YHR109W 1758 nt3.29□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YMR018WYMR018W 1545 nt3.29□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 BCS1YDR375C 1371 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 PHO81YGR233C 3537 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 TGL2YDR058C 981 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YDR124WYDR124W 975 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 USE1YGL098W 738 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RPS23AYGR118W 438 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YLR416CYLR416C 399 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 CTL1YMR180C 963 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RPS7AYOR096W 573 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 RPS23BYPR132W 438 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YBR089WYBR089W 600 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 EBS1YDR206W 2655 nt3.28□□□□□ -1.88
LDB17Q12342 YOR365CYOR365C 2112 nt3.28□□□□□ -1.89
LDB17Q12342 YGL214WYGL214W 486 nt3.27□□□□□ -1.89
LDB17Q12342 YGR168CYGR168C 1131 nt3.27□□□□□ -1.89
LDB17Q12342 PPE1YHR075C 1203 nt3.27□□□□□ -1.89
LDB17Q12342 MTD1YKR080W 963 nt3.27□□□□□ -1.89
LDB17Q12342 MTG1YMR097C 1104 nt3.27□□□□□ -1.89
LDB17Q12342 HUB1YNR032C-A 222 nt3.27□□□□□ -1.89
LDB17Q12342 RAS1YOR101W 930 nt3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms