Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 MSM1YGR171C 1728 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 STE24YJR117W 1362 nt3.5□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 CWH43YCR017C 2862 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 BCH1YMR237W 2175 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 NOG1YPL093W 1944 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 ARO80YDR421W 2853 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 DYN2YDR424C 279 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 PCL7YIL050W 858 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 SNX4YJL036W 1272 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 AHP1YLR109W 531 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RHO5YNL180C 996 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 ATG5YPL149W 885 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 MRPL27YBR282W 441 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 REG1YDR028C 3045 nt3.49□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 RDS2YPL133C 1341 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 TAF1YGR274C 3201 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 SPA2YLL021W 4401 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 GPP2YER062C 753 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 TYS1YGR185C 1185 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 EMC2YJR088C 879 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YLR042CYLR042C 486 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 USB1YLR132C 873 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 COQ5YML110C 924 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 CSR2YPR030W 3366 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 CET1YPL228W 1650 nt3.48□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 ENA5YDR038C 3276 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 NDC80YIL144W 2076 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 CCT7YJL111W 1653 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YEL025CYEL025C 3567 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 DET1YDR051C 1005 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 GRX2YDR513W 432 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 UBC8YEL012W 657 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 FUR1YHR128W 651 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YIL024CYIL024C 570 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YKL091CYKL091C 933 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YOL166CYOL166C 339 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 FIG1YBR040W 897 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 YBR300CYBR300C 498 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 DUN1YDL101C 1542 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 SSU1YPL092W 1377 nt3.47□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 TRS120YDR407C 3870 nt3.46□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 MON1YGL124C 1935 nt3.46□□□□□ -1.85
NFI1Q12216 TFB2YPL122C 1542 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 VBA4YDR119W 2307 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YDL242WYDL242W 354 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 NKP1YDR383C 717 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 SMT3YDR510W 306 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 IGO2YHR132W-A 396 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 EBP2YKL172W 1284 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 OST6YML019W 999 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 SYC1YOR179C 567 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YPR053CYPR053C 456 nt3.46□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 TFC1YBR123C 1950 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 TRX3YCR083W 384 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YDR442WYDR442W 393 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 TAN1YGL232W 870 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YBL010CYBL010C 843 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YMR141CYMR141C 309 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 RPS10BYMR230W 318 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 UBP5YER144C 2418 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 IOC3YFR013W 2364 nt3.45□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 MIT1YEL007W 2001 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 HFM1YGL251C 3564 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 VPS33YLR396C 2076 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 MIX14YDR031W 366 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 PTI1YGR156W 1278 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 RPS21BYJL136C 264 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YLR290CYLR290C 834 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 TRM112YNR046W 408 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YPL035CYPL035C 348 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 ARA1YBR149W 1035 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 LDH1YBR204C 1128 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 FAS1YKL182W 6156 nt3.44□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 SNT1YCR033W 3681 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 TEC1YBR083W 1461 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 CIN1YOR349W 3045 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 TSC13YDL015C 933 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 ARI1YGL157W 1044 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 PAN5YHR063C 1140 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 DPH1YIL103W 1278 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 CDC8YJR057W 651 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 AUR1YKL004W 1206 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 GLO1YML004C 981 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 EAF7YNL136W 1278 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 AAH1YNL141W 1044 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 IRC14YOR135C 342 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 RPS10AYOR293W 318 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 STP2YHR006W 1626 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 CDC45YLR103C 1953 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 JEN1YKL217W 1851 nt3.43□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 LCB4YOR171C 1875 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 FAP7YDL166C 594 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 RRG1YDR065W 1098 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 YDR271CYDR271C 372 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.42□□□□□ -1.86
NFI1Q12216 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.42□□□□□ -1.86
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