Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YDL176WYDL176W 2127 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 BSC2YDR275W 708 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 PAU10YDR542W 363 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 PAU11YGL261C 363 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 PAU13YHL046C 363 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 SPO16YHR153C 597 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 BET1YIL004C 429 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 IRC18YJL037W 675 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 PAU4YLR461W 363 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YBL065WYBL065W 345 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YOL050CYOL050C 321 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RPS11BYBR048W 471 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YBR096WYBR096W 693 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 FLO1YAR050W 4614 nt2.76□□□□□ -1.97
USB1Q12208 AEP3YPL005W 1821 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 SUP45YBR143C 1314 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 PCL9YDL179W 915 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 GRX3YDR098C 858 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RMT2YDR465C 1239 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 TLG1YDR468C 675 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 CDC26YFR036W 375 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 ARD1YHR013C 717 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 UNG1YML021C 1080 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 MSH2YOL090W 2895 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RRM3YHR031C 2172 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 REG1YDR028C 3045 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 MET10YFR030W 3108 nt2.75□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RPN1YHR027C 2982 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 DUF1YOL087C 3351 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 BMS1YPL217C 3552 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 CAB2YIL083C 1098 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YET2YMR040W 483 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 HMT1YBR034C 1047 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 TGL1YKL140W 1647 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 SIN4YNL236W 2925 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 CLG1YGL215W 1359 nt2.74□□□□□ -1.97
USB1Q12208 NDT80YHR124W 1884 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 ARP4YJL081C 1470 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 MIP6YHR015W 1980 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 snR57snR57 88 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 MRM2YGL136C 963 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 AML1YGR001C 747 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 SSU72YNL222W 621 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YBR300CYBR300C 498 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 MSM1YGR171C 1728 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 FAR1YJL157C 2493 nt2.73□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YPL109CYPL109C 1974 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 FRE2YKL220C 2136 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YHL012WYHL012W 1482 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 NTO1YPR031W 2247 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YDL162CYDL162C 357 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RPL1BYGL135W 654 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 COX23YHR116W 456 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 AGE2YIL044C 897 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 ERG20YJL167W 1059 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 AIM25YJR100C 984 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RPL19BYBL027W 570 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 SEC59YMR013C 1560 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 MFA2YNL145W 117 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 HUB1YNR032C-A 222 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RPL1AYPL220W 654 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 RSN1YMR266W 2862 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 CCT7YJL111W 1653 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 NOP4YPL043W 2058 nt2.72□□□□□ -1.97
USB1Q12208 PCI8YIL071C 1335 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SMC2YFR031C 3513 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YFL051CYFL051C 483 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 CGR1YGL029W 363 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 IME1YJR094C 1083 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 TUM1YOR251C 915 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YPR053CYPR053C 456 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 snR42snR42 351 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 CTM1YHR109W 1758 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 CDC40YDR364C 1368 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 PHO81YGR233C 3537 nt2.71□□□□□ -1.98
USB1Q12208 PAF1YBR279W 1338 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SPT2YER161C 1002 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 RPL30YGL030W 318 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SFH5YJL145W 885 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 ILV5YLR355C 1188 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 HSH49YOR319W 642 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 MSA1YOR066W 1890 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 CHS2YBR038W 2892 nt2.7□□□□□ -1.98
USB1Q12208 CLB5YPR120C 1308 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 MIX14YDR031W 366 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 DET1YDR051C 1005 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YPR1YDR368W 939 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 APA2YDR530C 978 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 GPP2YER062C 753 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SWD2YKL018W 990 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 CSM3YMR048W 954 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YOR082CYOR082C 342 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 EPL1YFL024C 2499 nt2.69□□□□□ -1.98
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