Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSL5	Q12186	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	TPM1	YNL079C	600 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	MRM1	YOR201C	1239 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YPL114W	YPL114W	420 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RFC5	YBR087W	1065 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RIM15	YFL033C	5313 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	BRE2	YLR015W	1518 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.14	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	TAF12	YDR145W	1620 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RTC1	YOL138C	4026 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	DSE2	YHR143W	978 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YJL133C-A	YJL133C-A	225 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	UBX4	YMR067C	1251 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	DDR48	YMR173W	1293 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YNL109W	YNL109W	546 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ZPS1	YOL154W	750 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RBL2	YOR265W	321 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.13	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	HMG1	YML075C	3165 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	OPT2	YPR194C	2634 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	FOX2	YKR009C	2703 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	GLN4	YOR168W	2430 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	CTK1	YKL139W	1587 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YDR535C	YDR535C	501 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RMD6	YEL072W	696 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	LOC1	YFR001W	615 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YGL152C	YGL152C	678 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	SAE3	YHR079C-A	276 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YIL161W	YIL161W	708 nt		4.12	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
MSL5	Q12186	YJL175W	YJL175W	513 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YPT7	YML001W	627 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ATP11	YNL315C	957 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	CSM4	YPL200W	471 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YSY6	YBR162W-A	198 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ARL1	YBR164C	552 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YDR170W-A	YDR170W-A	1323 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YNL284C-A	YNL284C-A	1323 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	CTS1	YLR286C	1689 nt		4.12	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	GRC3	YLL035W	1899 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	VPS17	YOR132W	1656 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	PHO13	YDL236W	939 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	BCP1	YDR361C	852 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	TFB3	YDR460W	966 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ENP2	YGR145W	2124 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YPT35	YHR105W	645 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ASG7	YJL170C	630 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YAR053W	YAR053W	297 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	SEC22	YLR268W	645 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YNL035C	YNL035C	1170 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	TOM22	YNL131W	459 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YNR071C	YNR071C	1029 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YPR016W-A	YPR016W-A	261 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	SAT4	YCR008W	1812 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	BUD27	YFL023W	2391 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	IOC4	YMR044W	1428 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	HPF1	YOL155C	2904 nt		4.11	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ASM4	YDL088C	1587 nt		4.1	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
MSL5	Q12186	SUC2	YIL162W	1599 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	HAP4	YKL109W	1665 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	snR5	snR5	204 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	FIN1	YDR130C	876 nt		4.1	□□□□□ -1.75	RIP-Chip
MSL5	Q12186	PEA2	YER149C	1263 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	PEP8	YJL053W	1140 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	AHP1	YLR109W	531 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YMR052C-A	YMR052C-A	366 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	ATG3	YNR007C	933 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	APC4	YDR118W	1959 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	NOP56	YLR197W	1515 nt		4.1	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	MDL1	YLR188W	2088 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	APA2	YDR530C	978 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	MIG2	YGL209W	1149 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YIL156W-A	YIL156W-A	402 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YKL063C	YKL063C	504 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RPC37	YKR025W	849 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	HRI1	YLR301W	735 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	RIM11	YMR139W	1113 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	YMR310C	YMR310C	954 nt		4.09	□□□□□ -1.75
MSL5	Q12186	NGL3	YML118W	1518 nt		4.09	□□□□□ -1.75

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