Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 RPL13AYDL082W 600 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 NOP6YDL213C 678 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MSS4YDR208W 2340 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 GUK1YDR454C 564 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 APA2YDR530C 978 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YGL108CYGL108C 423 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YGR026WYGR026W 837 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MSN4YKL062W 1893 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 ECM9YKR004C 1134 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SEC59YMR013C 1560 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YOR131CYOR131C 657 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SME1YOR159C 285 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YRM1YOR172W 2361 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MGE1YOR232W 687 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 CUP9YPL177C 921 nt3.57□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 KRE5YOR336W 4098 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MON1YGL124C 1935 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 CTM1YHR109W 1758 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 ROK1YGL171W 1695 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MTL1YGR023W 1656 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 KRE29YER038C 1395 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YDL162CYDL162C 357 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 PET100YDR079W 336 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 BSC2YDR275W 708 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 TAN1YGL232W 870 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 LST7YGR057C 729 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 GTR2YGR163W 1026 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YJR038CYJR038C 363 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 CCE1YKL011C 1062 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 NDL1YLR254C 570 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YPT6YLR262C 648 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YLR428CYLR428C 345 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 GLO1YML004C 981 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 PNG1YPL096W 1092 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SPN1YPR133C 1233 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YBR242WYBR242W 717 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SIP1YDR422C 2448 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SWH1YAR042W 3567 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 LOS1YKL205W 3303 nt3.56□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SPH1YLR313C 1593 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 AVT7YIL088C 1473 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 API2YDR525W 330 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 RGI1YER067W 486 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YGR064WYGR064W 369 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YGR190CYGR190C 366 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 FOL2YGR267C 732 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 COX2Q0250 756 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 THP2YHR167W 786 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 ECM16YMR128W 3804 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 ECM13YBL043W 774 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SIL1YOL031C 1266 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 FIG1YBR040W 897 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 GPI10YGL142C 1851 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 RPO31YOR116C 4383 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 RAD26YJR035W 3258 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SPT16YGL207W 3108 nt3.55□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 RNA14YMR061W 2034 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YPL109CYPL109C 1974 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 KIN2YLR096W 3444 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MAG1YER142C 891 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 AIM18YHR198C 966 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MMF1YIL051C 438 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YKL123WYKL123W 381 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YLR290CYLR290C 834 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 DSS4YPR017C 432 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 FYV5YCL058C 459 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 ALO1YML086C 1581 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 ERT1YBR239C 1590 nt3.54□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 SSM4YIL030C 3960 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YPR148CYPR148C 1308 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 TMA17YDL110C 453 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 BUD25YER014C-A 462 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YER034WYER034W 558 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 MPC3YGR243W 441 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YHI9YHR029C 885 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 REC104YHR157W 549 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 IDP2YLR174W 1239 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 YOR082CYOR082C 342 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 UBP12YJL197W 3765 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 DIT2YDR402C 1470 nt3.53□□□□□ -1.84
SSK1Q07084 PUB1YNL016W 1362 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 VPS38YLR360W 1320 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 RDS2YPL133C 1341 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YPR022CYPR022C 3402 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 PDS1YDR113C 1122 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 DOG2YHR043C 741 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 DOG1YHR044C 741 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YIL024CYIL024C 570 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 HIS5YIL116W 1158 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MAK16YAL025C 921 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 CDC8YJR057W 651 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 YMR310CYMR310C 954 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 SEC2YNL272C 2280 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 CHD1YER164W 4407 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 MNR2YKL064W 2910 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 ELM1YKL048C 1923 nt3.52□□□□□ -1.85
SSK1Q07084 BCS1YDR375C 1371 nt3.51□□□□□ -1.85
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