Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK18Q07002 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK18Q07002 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms