Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 snR54snR54 86 nt5.55□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 MCM6YGL201C 3054 nt5.55□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 TNA1YGR260W 1605 nt5.55□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 DHR2YKL078W 2208 nt5.55□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 EPS1YIL005W 2106 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 PSY4YBL046W 1326 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 CTS1YLR286C 1689 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 YCL065WYCL065W 369 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 YRA1YDR381W 681 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 CTK3YML112W 891 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 YMR141CYMR141C 309 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 RHO2YNL090W 579 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 YAF9YNL107W 681 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 CKA2YOR061W 1020 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 MUD2YKL074C 1584 nt5.54□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 FAD1YDL045C 921 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 TFB3YDR460W 966 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 SCS2YER120W 735 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 MAM33YIL070C 801 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 LDB18YLL049W 540 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 TIF11YMR260C 462 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 MCM16YPR046W 546 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 SPN1YPR133C 1233 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 SSL1YLR005W 1386 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 YOR365CYOR365C 2112 nt5.53□□□□□ -1.52
HDA3Q06623 GAL80YML051W 1308 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RTC5YOR118W 1704 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 HOM3YER052C 1584 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 HMRA2YCR096C 360 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RTS3YGR161C 792 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 BNA1YJR025C 534 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YMR315WYMR315W 1050 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YOR392WYOR392W 444 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ICY2YPL250C 411 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 BUL1YMR275C 2931 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 PAL1YDR348C 1500 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ATG20YDL113C 1923 nt5.52□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 CDC48YDL126C 2508 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YPR148CYPR148C 1308 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YPD1YDL235C 504 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 MPC3YGR243W 441 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ATP14YLR295C 375 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 TDA5YLR426W 981 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YNL089CYNL089C 477 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RRT16YNL105W 429 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ASH1YKL185W 1767 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 VPS33YLR396C 2076 nt5.51□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ANR2YKL047W 1551 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 POL12YBL035C 2118 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 UBX5YDR330W 1503 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YDL071CYDL071C 375 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YDR355CYDR355C 303 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RPL8AYHL033C 771 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 PHO86YJL117W 936 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YJL220WYJL220W 453 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YKL066WYKL066W 444 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 AIM29YKR074W 468 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 COQ10YOL008W 624 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ROX1YPR065W 1107 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RTS1YOR014W 2274 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 SKO1YNL167C 1944 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 MTL1YGR023W 1656 nt5.5□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 EIS1YMR031C 2532 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RNR3YIL066C 2610 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 TDA11YHR159W 1515 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 MKK2YPL140C 1521 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YBR139WYBR139W 1527 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 SMB1YER029C 591 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 LIF1YGL090W 1266 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YIL060WYIL060W 435 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YJL169WYJL169W 369 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YKL223WYKL223W 333 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 PBA1YLR199C 831 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 GSY2YLR258W 2118 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RET1YOR207C 3450 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 FAR8YMR029C 1572 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ACS2YLR153C 2052 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 TEA1YOR337W 2280 nt5.49□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 BIK1YCL029C 1323 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 MSM1YGR171C 1728 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 VHR1YIL056W 1923 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 PUF3YLL013C 2640 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ARP5YNL059C 2268 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 SLO1YER180C-A 258 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YGL108CYGL108C 423 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RSM25YIL093C 795 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RPL17BYJL177W 555 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 PGU1YJR153W 1086 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RNH203YLR154C 333 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YML031C-AYML031C-A 336 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 COQ5YML110C 924 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 POP3YNL282W 588 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YNL337WYNL337W 255 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YPL114WYPL114W 420 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.7 ms