Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPN12Q05209 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPN12Q05209 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPN12Q05209 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms