Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CD164Q04900 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD164Q04900 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CD164Q04900 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CD164Q04900 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CD164Q04900 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CD164Q04900 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms