Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
IRF8Q02556 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms