Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HSF1Q00613 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms