Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FANCCQ00597 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FANCCQ00597 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms