Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMF1P82094 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMF1P82094 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TMF1P82094 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TMF1P82094 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TMF1P82094 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TMF1P82094 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMF1P82094 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMF1P82094 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMF1P82094 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMF1P82094 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMF1P82094 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMF1P82094 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMF1P82094 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMF1P82094 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMF1P82094 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMF1P82094 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMF1P82094 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMF1P82094 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMF1P82094 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMF1P82094 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms