Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PITX1P78337 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITX1P78337 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITX1P78337 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITX1P78337 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PITX1P78337 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PITX1P78337 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PITX1P78337 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PITX1P78337 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms