Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVK11-1P61568 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVK11-1P61568 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms