Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2KP53803 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2KP53803 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms