Protein–RNA interactions for Protein: P53158

KXD1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit KXD1, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KXD1P53158 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 BLI1YKL061W 342 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 MCM1YMR043W 861 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 PIG2YIL045W 1617 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 GAT2YMR136W 1683 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 EXO5YBR163W 1758 nt5.87□□□□□ -1.47
KXD1P53158 MEF1YLR069C 2286 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 GEM1YAL048C 1989 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 RKM3YBR030W 1659 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 GUD1YDL238C 1470 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 ERG4YGL012W 1422 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 RMT2YDR465C 1239 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YHI9YHR029C 885 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 MOG1YJR074W 657 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 ASK1YKL052C 879 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 SUS1YBR111W-A 291 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 AIM4YBR194W 372 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 HRQ1YDR291W 3234 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 SKN1YGR143W 2316 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YOL036WYOL036W 2286 nt5.86□□□□□ -1.47
KXD1P53158 ASH1YKL185W 1767 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 SER33YIL074C 1410 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 GEF1YJR040W 2340 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YTP1YNL237W 1380 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 ADE12YNL220W 1302 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 OTU2YHL013C 924 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 RPL18BYNL301C 561 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 VPS69YPR087W 321 nt5.85□□□□□ -1.47
KXD1P53158 EFT2YDR385W 2529 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 EFT1YOR133W 2529 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 PAM1YDR251W 2493 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YCR090CYCR090C 549 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 MRPL11YDL202W 750 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 API2YDR525W 330 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 CRG1YHR209W 876 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 COA1YIL157C 594 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YIR020CYIR020C 303 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 CIS3YJL158C 684 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YJR012CYJR012C 624 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YML6YML025C 861 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 GPB1YOR371C 2694 nt5.84□□□□□ -1.47
KXD1P53158 AYT1YLL063C 1425 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 PMA1YGL008C 2757 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YEL068CYEL068C 333 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 RPS5YJR123W 678 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 ERG2YMR202W 669 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YOR277CYOR277C 309 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 MRPS16YPL013C 366 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 DER1YBR201W 636 nt5.83□□□□□ -1.48
KXD1P53158 KIN3YAR018C 1308 nt5.82□□□□□ -1.48
KXD1P53158 RPS16BYDL083C 432 nt5.82□□□□□ -1.48
KXD1P53158 HNT1YDL125C 477 nt5.82□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YIL054WYIL054W 318 nt5.82□□□□□ -1.48
KXD1P53158 ENV9YOR246C 993 nt5.82□□□□□ -1.48
KXD1P53158 UBP6YFR010W 1500 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 ERV1YGR029W 570 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 RPL8AYHL033C 771 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YIR042CYIR042C 711 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 RPL17BYJL177W 555 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YPT53YNL093W 663 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YNL205CYNL205C 423 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 KEL1YHR158C 3495 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 DSS1YMR287C 2910 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 ALG11YNL048W 1647 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 MSE1YOL033W 1611 nt5.81□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YCR007CYCR007C 720 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 TFB3YDR460W 966 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 RPB3YIL021W 957 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 BCY1YIL033C 1251 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 CSE4YKL049C 690 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 ATG10YLL042C 504 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 ARG80YMR042W 534 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 NHA1YLR138W 2958 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 CDC55YGL190C 1581 nt5.8□□□□□ -1.48
KXD1P53158 IMA5YJL216C 1746 nt5.79□□□□□ -1.48
KXD1P53158 SIA1YOR137C 1869 nt5.79□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YME1YPR024W 2244 nt5.79□□□□□ -1.48
KXD1P53158 ASI3YNL008C 2031 nt5.79□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.79□□□□□ -1.48
KXD1P53158 YGL193CYGL193C 312 nt5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.1 ms