Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 DET1YDR051C 1005 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YDR149CYDR149C 708 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 DYN2YDR424C 279 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YGL082WYGL082W 1146 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 PCL7YIL050W 858 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 PET130YJL023C 1044 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 ECM4YKR076W 1113 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 EAF7YNL136W 1278 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 PFK27YOL136C 1194 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YOR238WYOR238W 912 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 DIB1YPR082C 432 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 CMD1YBR109C 444 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 KAP104YBR017C 2757 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 ULP1YPL020C 1866 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 NEM1YHR004C 1341 nt2.9□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RPS14AYCR031C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RDI1YDL135C 609 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 PEX10YDR265W 1014 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 HIM1YDR317W 1245 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SOL3YHR163W 750 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RPS21BYJL136C 264 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RPL22AYLR061W 366 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SEC65YML105C 822 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 TPM1YNL079C 600 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SPP381YBR152W 876 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YBR242WYBR242W 717 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SNQ2YDR011W 4506 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 MAL12YGR292W 1755 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 MAL32YBR299W 1755 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 CAF130YGR134W 3369 nt2.89□□□□□ -1.95
UFD1P53044 DAP2YHR028C 2457 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SDS23YGL056C 1584 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SER3YER081W 1410 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RNH202YDR279W 1053 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YOS1YER074W-A 258 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 MBR1YKL093W 1020 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 POP8YBL018C 402 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 CTL1YMR180C 963 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RPS10BYMR230W 318 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YNL320WYNL320W 855 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YBL096CYBL096C 309 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SIL1YOL031C 1266 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YOR114WYOR114W 885 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YBR096WYBR096W 693 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 LDH1YBR204C 1128 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YBR300CYBR300C 498 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 TMA108YIL137C 2841 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 CPA2YJR109C 3357 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 ACA1YER045C 1470 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 CCT7YJL111W 1653 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 ACK1YDL203C 1872 nt2.88□□□□□ -1.95
UFD1P53044 TRM12YML005W 1389 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 NUF2YOL069W 1356 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 FAS1YKL182W 6156 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YHR080CYHR080C 4038 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SIZ1YDR409W 2715 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 AEP3YPL005W 1821 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 ERJ5YFR041C 888 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 AIM26YKL037W 357 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 USB1YLR132C 873 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 ATG16YMR159C 453 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 IZH2YOL002C 954 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YOR263CYOR263C 408 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 VPS33YLR396C 2076 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 ISM1YPL040C 3009 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 BCS1YDR375C 1371 nt2.87□□□□□ -1.95
UFD1P53044 TIF4631YGR162W 2859 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 TSC11YER093C 4293 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 DBP5YOR046C 1449 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 LCB4YOR171C 1875 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YOR365CYOR365C 2112 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 TEC1YBR083W 1461 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 GRX3YDR098C 858 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YGR026WYGR026W 837 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 MTM1YGR257C 1101 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 PHD1YKL043W 1101 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YMR141CYMR141C 309 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SUT2YPR009W 807 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RIB5YBR256C 717 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 TFC1YBR123C 1950 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RPN4YDL020C 1596 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 PLM2YDR501W 1566 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 MSS4YDR208W 2340 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 OAF3YKR064W 2592 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 BUD4YJR092W 4344 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 PRM15YMR278W 1869 nt2.86□□□□□ -1.95
UFD1P53044 MRS2YOR334W 1413 nt2.85□□□□□ -1.95
UFD1P53044 SLM2YNL047C 1971 nt2.85□□□□□ -1.95
UFD1P53044 YPL109CYPL109C 1974 nt2.85□□□□□ -1.95
UFD1P53044 AKR1YDR264C 2295 nt2.85□□□□□ -1.95
UFD1P53044 CEX1YOR112W 2286 nt2.85□□□□□ -1.95
UFD1P53044 RPA190YOR341W 4995 nt2.85□□□□□ -1.95
UFD1P53044 BSC2YDR275W 708 nt2.85□□□□□ -1.95
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