Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP4P49662 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP4P49662 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP4P49662 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP4P49662 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP4P49662 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP4P49662 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP4P49662 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP4P49662 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP4P49662 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP4P49662 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP4P49662 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP4P49662 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP4P49662 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP4P49662 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP4P49662 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP4P49662 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP4P49662 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP4P49662 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP4P49662 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP4P49662 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP4P49662 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP4P49662 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP4P49662 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms