Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIA4P48058 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms