Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACADSBP45954 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms