Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PIK3CBP42338 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms