Protein–RNA interactions for Protein: P39928

SLN1, Osmosensing histidine protein kinase SLN1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLN1P39928 YGL199CYGL199C 471 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 RPL16AYIL133C 600 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YIL175WYIL175W 318 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YJR087WYJR087W 351 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YLR171WYLR171W 390 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YSF3YNL138W-A 258 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 THI20YOL055C 1656 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 RAD28YDR030C 1521 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YDL071CYDL071C 375 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YDL183CYDL183C 963 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 IZH1YDR492W 951 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YGR039WYGR039W 312 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GRE3YHR104W 984 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 BRX1YOL077C 876 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 ATG5YPL149W 885 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GRE1YPL223C 507 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 STR2YJR130C 1920 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GIP1YBR045C 1920 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 SAF1YBR280C 1914 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 SLF1YDR515W 1344 nt5.42□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GCR2YNL199C 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YCL075WYCL075W 441 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 MRH1YDR033W 963 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 ATP8Q0080 147 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 SNL1YIL016W 480 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 IES3YLR052W 753 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 AIM39YOL053W 1188 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 snR41snR41 95 nt5.41□□□□□ -1.54
SLN1P39928 KIC1YHR102W 3243 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YER158CYER158C 1722 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 PUG1YER185W 912 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 LOC1YFR001W 615 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YKL066WYKL066W 444 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 AIM32YML050W 936 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 TMA16YOR252W 537 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 OPY1YBR129C 987 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 STP22YCL008C 1158 nt5.4□□□□□ -1.54
SLN1P39928 SUC2YIL162W 1599 nt5.4□□□□□ -1.55
SLN1P39928 TUL1YKL034W 2277 nt5.4□□□□□ -1.55
SLN1P39928 IMA3YIL172C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 IMA4YJL221C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 BUD8YLR353W 1812 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 ARC1YGL105W 1131 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YGR069WYGR069W 336 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 PEX21YGR239C 867 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YPT35YHR105W 645 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YLR224WYLR224W 1110 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 FBP1YLR377C 1047 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 UBX4YMR067C 1251 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 SAP30YMR263W 606 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YOP1YPR028W 543 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 NUP2YLR335W 2163 nt5.39□□□□□ -1.55
SLN1P39928 RAD16YBR114W 2373 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 APC4YDR118W 1959 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 MAL12YGR292W 1755 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 IXR1YKL032C 1794 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 MAL32YBR299W 1755 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 RIM1YCR028C-A 408 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YER190C-BYER190C-B 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YFL068WYFL068W 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 NAT2YGR147C 867 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YJR037WYJR037W 384 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 DSS4YPR017C 432 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.38□□□□□ -1.55
SLN1P39928 RTT109YLL002W 1311 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms