Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPARGP37231 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPARGP37231 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPARGP37231 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPARGP37231 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPARGP37231 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGP37231 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGP37231 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGP37231 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGP37231 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGP37231 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGP37231 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPARGP37231 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms