Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN2P35609 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms