Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRDP23468 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRDP23468 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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