Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF35P13682 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF35P13682 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms