Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CALM3P0DP25 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALM3P0DP25 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms