Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOP08100 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOP08100 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOP08100 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOP08100 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOP08100 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOP08100 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOP08100 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOP08100 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOP08100 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOP08100 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOP08100 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOP08100 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms