Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRM2P04554 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRM2P04554 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRM2P04554 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRM2P04554 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRM2P04554 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRM2P04554 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRM2P04554 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRM2P04554 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms