Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNAP02545 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNAP02545 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMNAP02545 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMNAP02545 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMNAP02545 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNAP02545 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNAP02545 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNAP02545 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNAP02545 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNAP02545 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNAP02545 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNAP02545 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms