Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIOO75962 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIOO75962 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIOO75962 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOO75962 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOO75962 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOO75962 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOO75962 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIOO75962 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOO75962 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOO75962 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIOO75962 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIOO75962 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIOO75962 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms